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免疫学研究与影像

人和小鼠SLAM基因座的基因组组织

编码信号淋巴细胞激活分子(signaling lymphocyte activation molecule, SLAM)家族成员的基因位于人类染色体1q23和小鼠染色体1h2上. 7个属于slam家族的基因聚集在一个约400kb的基因组片段中, 在人类和老鼠身上都有. slam基因家族的排列在两个基因组中是相同的. The only difference is their orientation; the genes in humans closer to the centromere are situated in mice closer to the telomere. 另外三个属于slam家族的基因(SLAMF8和SLAMF9)位于同一染色体区域, 但在SLAM位点之外. 人类的EAT-2和小鼠的Eat-2a和Eat-2b也位于SLAM位点附近. 填充框表示包含一整套基因外显子的序列块. 黑色箭头表示这些基因的转录方向.

SAP与Fyn结合的结构

结合位点的放大视图

上图:三元SLAM-SAP-Fyn-SH3配合物整体结构的带状图. SAP的SH2结构域(紫色)通过不重叠slam结合位点(橙色)的非规范表面相互作用(框状区域)与Fyn-SH3结构域(绿色)结合。.

下图:SAP-Fyn相互作用中涉及的关键氨基酸特写. SAP residues are displayed in pink and labeled in black; Fyn-SH3 residues are shown in yellow and labeled in blue. 蓝色虚线表示临界氢键和离子相互作用.

小鼠1号染色体Sle位点

小鼠1号染色体Sle位点上半部分为小鼠1号染色体的基因组图谱，以及SLAM受体和EAT-2位点的位置. 填充框表示包含一整套基因外显子的序列块. 下半部分显示了组成Sle1位点(Sle1a)的三个已定义区域, Sle1b, 和Sle1c), 以及基因组标记和邻近基因. Sle1a定位于基因组标记D1Mit15和D1Mit353之间约1-cM的间隔, Sle1b位于D1Mit148和D1Mit149之间大小大致相同的区间内, 而Sle1c则映射到1号染色体的端粒末端, 特别是在D1Mit274和D1Mit155之间约2cm的间隔. Eat-2和SLAM受体位点分别位于Sle1a和Sle1b区域. 基因组标记及其在1号染色体上的位置被标注在地图上.

人类SH2D1A基因突变

已报道的人类SH2D1A突变与基因组组织或功能域一起显示. SH2D1A的编码区和50UTR/30UTR分别以白色和黑色条表示. 错义突变的氨基酸位置用黑色表示，无义突变用红色表示. 在第3外显子544核苷酸位置插入一个腺苷残基，导致在第82氨基酸(fs82)上发生移码。. 这个移码产生了一个由20个残基组成的不同的氨基酸序列, 随后在103号氨基酸处引入过早终止密码子. 终止密码子的点突变在蛋白(RRKIKHLVLYFL)上增加了(R129Stop) 12个氨基酸残基。. SH2D1A尾部GTT缺失的自然变异呈菱形. CAAT框和剪接突变用箭头表示:a, ccaat to ctaat; b, t(+2)c; c, g(-1)t/a; d, a (-2)c; e, c(-3)g that results in exon 2 skipping; f, g(+1)a; g, G (-1) a和导致外显子3的跳跃. +表示供体剪接位点和受体剪接位点.

小鼠SLAM受体的变异

小鼠slam家族受体单倍型1和单倍型2之间的氨基酸差异用绿色交叉(在先导肽序列中发现的)或红色交叉(在蛋白质的其余部分发现的)表示。. 包含多个氨基酸差异的区域显示为红色框. 箭头表示ITSM主题. 蓝线为短异构体的c端. 紫色框表示CD48的GPI-linked结构域.